تشمل مضاعفات علاج قناة الجذر:
1. ألم ما بعد الجراحة والتورم: الإصابة النسبية أعلى ، 25-40 ٪. ومع ذلك ، فهي ليست خطيرة بشكل عام ، مقبولة ، وسوف تتحسن بعد أسبوع ؛
2. الجهاز يخترق الثقب القمي ويدمر الأنسجة المحيطية ؛
3. الأداة مكسورة في قناة الجذر.
4. كسر الأسنان: كسر التاج ، كسر الجذر ، التاج وكسر الجذر ؛
5. خدر الشفة السفلى ؛
6. انتفاخ الرئة تحت الجلد.








